При применении в терапевтических дозах побочные эффекты встречаются редко, среди них: чиханье, раздражение, жжение, сухость в носу; сыпь, крапивница, ангионевротический отек и инфекции носоглотки, вызванные грибковой флорой, ринорея, головная боль.
В редких случаях — носовое кровотечение, гиперемия конъюнктивы, повышение внутриглазного давления, миалгия, сонливость, кашель, снижение вкусовых ощущений, атрофия слизистой оболочки носа. Крайне редко — изъязвление слизистой оболочки полости носа, перфорация носовой перегородки.
При длительном применении в дозах более 1500 мкг/сут — системные побочные эффекты (в т.ч. надпочечниковая недостаточность).