Почти полностью резорбируется из ЖКТ путем пассивной диффузии в тонком кишечнике и активной резорбции — в подвздошной кишке. Хенодеоксихолевая кислота в печени конъюгирует с глицином и таурином, образуя гликохолевую и таурохолевую кислоты, в виде которых или их солей с натрием или калием выделяется с желчью в просвет кишечника. Небольшая часть выделяется с испражнениями, другая — через воротную вену возвращается в печень, где деконъюгируется. Бактериальные энзимы в кишечнике дегидроксилируют конъюгированную хенодеоксихолевую кислоту в литохолевую, которая также реабсорбируется и гидролизуется в печени.