По данным клинических исследований. Данные о частоте развития нежелательных лекарственных реакций, связанных с применением сулодексида, были получены в ходе клинических исследований с участием пациентов, проходивших лечение стандартными дозами препарата при обычной продолжительности курса терапии. Нежелательные реакции, связанные с применением сулодексида, были классифицированы по системно-органным классам и распределены по частоте возникновения в следующем порядке: очень часто (≥ 1/10), часто (≥1/100 до <1/10), нечасто (≥1/1000 до <1/100), редко (≥1/10000 до <1/1000), очень редко (<1/10000).
Со стороны нервной системы: нечасто —  головная боль, очень редко —  потеря сознания.
Со стороны органа слуха и вестибулярного аппарата: часто —  головокружение.
Со стороны ЖКТ:  часто —  боль в верхней части живота, диарея, тошнота, нечасто —  ощущение дискомфорта в животе, диспепсия, метеоризм, рвота, очень редко —  желудочное кровотечение.
Аллергические реакции: часто —  кожная сыпь различной локализации, нечасто —  экзема, эритема, крапивница.
По данным пострегистрационных наблюдений. В ходе пострегистрационного применения сулодексида были зарегистрированы дополнительные нежелательные явления: анемия, нарушения метаболизма плазменных белков, расстройства ЖКТ,  мелена, ангионевротический отек, экхимоз, генитальный отек, генитальная эритема, полименорея. Частота данных нежелательных эффектов не может быть оценена, в связи с тем что информация о них поступает в виде спонтанных сообщений. Соответственно, частота этих нежелательных явлений классифицируется как неизвестная (не может быть рассчитана на основании имеющихся данных).